克林霉素磷酸酯凝胶在使用之后常见的不良反应有:局部皮肤干燥、接触性皮炎、皮肤刺激反应、过敏症状、腹痛、胃肠不适、眼睛刺痛等;个别可能有腹泻、血样腹泻、结肠炎包括假膜性结肠炎等。如果患者在使用期间遇到以上这些不良反应,应该保持冷静,必要时及时的就医。